Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NFKBIAP25963 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms