Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms