Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRGP23470 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms