Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD247P20963 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD247P20963 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD247P20963 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD247P20963 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD247P20963 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD247P20963 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD247P20963 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD247P20963 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD247P20963 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD247P20963 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD247P20963 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD247P20963 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD247P20963 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD247P20963 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD247P20963 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD247P20963 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD247P20963 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD247P20963 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD247P20963 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD247P20963 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD247P20963 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD247P20963 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD247P20963 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD247P20963 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD247P20963 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD247P20963 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD247P20963 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD247P20963 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms