Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms