Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DESP17661 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DESP17661 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DESP17661 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DESP17661 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DESP17661 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DESP17661 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DESP17661 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DESP17661 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DESP17661 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DESP17661 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DESP17661 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DESP17661 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DESP17661 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DESP17661 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DESP17661 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DESP17661 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DESP17661 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DESP17661 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DESP17661 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DESP17661 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DESP17661 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DESP17661 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DESP17661 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DESP17661 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DESP17661 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DESP17661 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DESP17661 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DESP17661 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DESP17661 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DESP17661 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DESP17661 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DESP17661 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DESP17661 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DESP17661 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DESP17661 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DESP17661 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DESP17661 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DESP17661 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DESP17661 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DESP17661 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DESP17661 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DESP17661 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DESP17661 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DESP17661 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms