Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFTRP13569 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFTRP13569 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFTRP13569 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CFTRP13569 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFTRP13569 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFTRP13569 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFTRP13569 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFTRP13569 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CFTRP13569 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CFTRP13569 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CFTRP13569 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFTRP13569 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFTRP13569 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFTRP13569 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFTRP13569 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFTRP13569 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFTRP13569 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFTRP13569 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CFTRP13569 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFTRP13569 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CFTRP13569 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CFTRP13569 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CFTRP13569 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFTRP13569 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFTRP13569 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFTRP13569 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFTRP13569 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFTRP13569 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFTRP13569 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFTRP13569 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CFTRP13569 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFTRP13569 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CFTRP13569 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFTRP13569 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFTRP13569 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFTRP13569 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFTRP13569 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFTRP13569 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFTRP13569 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFTRP13569 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFTRP13569 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFTRP13569 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFTRP13569 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFTRP13569 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFTRP13569 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFTRP13569 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFTRP13569 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CFTRP13569 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFTRP13569 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFTRP13569 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFTRP13569 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFTRP13569 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CFTRP13569 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFTRP13569 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFTRP13569 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFTRP13569 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFTRP13569 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFTRP13569 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFTRP13569 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFTRP13569 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFTRP13569 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFTRP13569 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms