Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCL2P13500 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCL2P13500 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCL2P13500 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCL2P13500 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCL2P13500 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCL2P13500 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCL2P13500 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL2P13500 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL2P13500 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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