Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM228BP0C875 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms