Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Y4

KRTAP1-4, Keratin-associated protein 1-4, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-4P0C5Y4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP1-4P0C5Y4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms