Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
THY1P04216 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THY1P04216 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THY1P04216 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THY1P04216 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THY1P04216 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THY1P04216 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THY1P04216 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THY1P04216 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THY1P04216 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THY1P04216 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THY1P04216 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THY1P04216 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THY1P04216 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THY1P04216 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THY1P04216 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THY1P04216 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THY1P04216 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THY1P04216 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THY1P04216 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THY1P04216 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THY1P04216 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THY1P04216 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms