Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

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Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF3O95398 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF3O95398 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
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