Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG7O95352 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG7O95352 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG7O95352 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG7O95352 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG7O95352 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG7O95352 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG7O95352 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG7O95352 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG7O95352 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG7O95352 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG7O95352 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG7O95352 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG7O95352 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG7O95352 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG7O95352 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATG7O95352 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG7O95352 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG7O95352 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG7O95352 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG7O95352 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG7O95352 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG7O95352 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG7O95352 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG7O95352 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG7O95352 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG7O95352 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG7O95352 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG7O95352 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG7O95352 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG7O95352 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG7O95352 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG7O95352 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG7O95352 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG7O95352 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG7O95352 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG7O95352 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG7O95352 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG7O95352 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG7O95352 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG7O95352 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms