Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms