Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms