Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PHOX2AO14813 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms