Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD8O14715 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms