Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTDSP2O14595 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms