Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F3O00716 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F3O00716 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F3O00716 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F3O00716 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F3O00716 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F3O00716 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F3O00716 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F3O00716 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms