Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRPO00591 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRPO00591 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRPO00591 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRPO00591 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRPO00591 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRPO00591 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRPO00591 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRPO00591 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRPO00591 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRPO00591 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRPO00591 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRPO00591 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRPO00591 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRPO00591 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRPO00591 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRPO00591 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRPO00591 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRPO00591 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRPO00591 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRPO00591 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRPO00591 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRPO00591 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRPO00591 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms