Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PIK3C2AO00443 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms