Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVH48-1M5A8F1 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms