Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOC4-APOC2K7ER74 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms