Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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