Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms