Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms