Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms