Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A8MVJ9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A8MVJ9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A8MVJ9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A8MVJ9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A8MVJ9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A8MVJ9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A8MVJ9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A8MVJ9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
A8MVJ9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A8MVJ9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A8MVJ9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A8MVJ9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A8MVJ9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A8MVJ9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A8MVJ9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A8MVJ9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A8MVJ9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A8MVJ9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms