Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms