Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MAP3K4Q9Y6R4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAP3K4Q9Y6R4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms