Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms