Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms