Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GIT1Q9Y2X7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIT1Q9Y2X7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms