Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms