Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms