Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTF2Q9UNY4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms