Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS4AQ9UN37 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VPS4AQ9UN37 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VPS4AQ9UN37 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
VPS4AQ9UN37 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VPS4AQ9UN37 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VPS4AQ9UN37 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VPS4AQ9UN37 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VPS4AQ9UN37 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VPS4AQ9UN37 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VPS4AQ9UN37 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VPS4AQ9UN37 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VPS4AQ9UN37 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VPS4AQ9UN37 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VPS4AQ9UN37 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPS4AQ9UN37 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPS4AQ9UN37 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPS4AQ9UN37 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPS4AQ9UN37 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPS4AQ9UN37 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPS4AQ9UN37 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPS4AQ9UN37 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VPS4AQ9UN37 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPS4AQ9UN37 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms