Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DSEQ9UL01 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSEQ9UL01 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms