Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA11Q9UKX5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA11Q9UKX5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms