Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms