Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSFQ9UBX1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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