Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms