Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP35Q9P2H5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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