Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRFN1Q9P244 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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