Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CCDC180Q9P1Z9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC180Q9P1Z9 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms