Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHRF1Q9P1Y6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms