Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNK4Q9NYG8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNK4Q9NYG8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms