Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDAP2Q9NXN4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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