Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms