Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms